Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms