Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Zbed4Q80WQ9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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Zbed4Q80WQ9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Zbed4Q80WQ9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Zbed4Q80WQ9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Zbed4Q80WQ9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Zbed4Q80WQ9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Zbed4Q80WQ9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Zbed4Q80WQ9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Zbed4Q80WQ9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Zbed4Q80WQ9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Zbed4Q80WQ9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Zbed4Q80WQ9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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