Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc1Q80VQ1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc1Q80VQ1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc1Q80VQ1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc1Q80VQ1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc1Q80VQ1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc1Q80VQ1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc1Q80VQ1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc1Q80VQ1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc1Q80VQ1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc1Q80VQ1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc1Q80VQ1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc1Q80VQ1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc1Q80VQ1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc1Q80VQ1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc1Q80VQ1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc1Q80VQ1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc1Q80VQ1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc1Q80VQ1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms