Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms