Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms