Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

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Length 1,164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sgo2Q7TSY8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms