Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms