Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms