Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms