Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms