Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms