Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd3eapQ76KJ5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms