Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms