Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv1Q704Y3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms