Protein–RNA interactions for Protein: Q6RT24

Cenpe, Centromere-associated protein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpeQ6RT24 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CenpeQ6RT24 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms