Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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