Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Trim37Q6PCX9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Trim37Q6PCX9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Trim37Q6PCX9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Trim37Q6PCX9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Trim37Q6PCX9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Trim37Q6PCX9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Trim37Q6PCX9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Trim37Q6PCX9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Trim37Q6PCX9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Trim37Q6PCX9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Trim37Q6PCX9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms