Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RgmaQ6PCX7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms