Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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