Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Usp49Q6P9L4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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