Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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