Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrig3Q6P1C6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms