Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms