Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms