Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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Tpm4Q6IRU2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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