Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms