Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TroQ6DIC6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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