Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms