Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Top2bQ64511 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms