Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
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