Protein–RNA interactions for Protein: Q61660

Foxj1, Forkhead box protein J1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxj1Q61660 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms