Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EsrrbQ61539 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EsrrbQ61539 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EsrrbQ61539 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EsrrbQ61539 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EsrrbQ61539 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EsrrbQ61539 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EsrrbQ61539 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EsrrbQ61539 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EsrrbQ61539 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EsrrbQ61539 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EsrrbQ61539 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EsrrbQ61539 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EsrrbQ61539 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EsrrbQ61539 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EsrrbQ61539 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EsrrbQ61539 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EsrrbQ61539 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EsrrbQ61539 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EsrrbQ61539 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EsrrbQ61539 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EsrrbQ61539 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EsrrbQ61539 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EsrrbQ61539 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EsrrbQ61539 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EsrrbQ61539 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms