Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms