Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms