Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms