Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms