Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms