Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcf4Q60722 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcf4Q60722 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcf4Q60722 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcf4Q60722 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tcf4Q60722 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcf4Q60722 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tcf4Q60722 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tcf4Q60722 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcf4Q60722 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcf4Q60722 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tcf4Q60722 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms