Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms