Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms