Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms