Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms