Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms