Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11487Q5RIS0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms