Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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