Protein–RNA interactions for Protein: Q5JCT0

Gcnt3, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt3Q5JCT0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gcnt3Q5JCT0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gcnt3Q5JCT0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gcnt3Q5JCT0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gcnt3Q5JCT0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gcnt3Q5JCT0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gcnt3Q5JCT0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gcnt3Q5JCT0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gcnt3Q5JCT0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gcnt3Q5JCT0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gcnt3Q5JCT0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcnt3Q5JCT0 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms