Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms