Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms