Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms