Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syne3Q4FZC9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syne3Q4FZC9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syne3Q4FZC9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syne3Q4FZC9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syne3Q4FZC9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syne3Q4FZC9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Syne3Q4FZC9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Syne3Q4FZC9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syne3Q4FZC9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Syne3Q4FZC9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms